有露台、天台、天台屋、花園、停車位等建築的村屋皆要小心，此類單位有機會是違契僭建單位。承造按揭前，銀行會派人到場檢查單位，當看到其單位有僭建時，在批核按揭時會要求買家還原單位，把原批出的價款額扣除還原單位的費用作為新的按揭批核金額，因此批唔足貸款額。有一些僭建案例更為複雜的村屋，像是有地牢、花園泳池、將上下兩層打通等等，由於還原費用極高，銀行高機率會唔批按揭。

銀行不會為任何村屋樓花做按揭，直到村屋起好後才可以申請按揭，準業主亦要留意要獲得滿意紙才可以申請按揭。如果無滿意紙的話，即使是已落成村屋單位，銀行都不會批出按揭。

很多落地太舊的村屋都可能會遺失平面圖或一些重要的樓宇文件，像是沒有圖則、已遺失圖則、沒有屋契、轉名契等重要文件等，銀行都很難批其村屋按揭申請。

村屋有轉讓限制，所以銀行在審批方面特別嚴格。村屋會分為 3 類，分別是丁屋、舊屋和臨屋。基本上，除了丁屋之外，其他2個都會被銀行拒絕承造按揭。

村屋單位容易發生「道路使用權」的問題，因村屋業權不一定包括附近出入口通道的路權。路權是較複雜的概念，例如該村屋單位周圍都可能被私家路圍繞，村屋業主沒有公家路能夠直達屋前，甚至連屋企都入唔到，即使銀行有一日收樓，但連間屋都入唔到，所以一定唔批按揭。

村屋出現估價不足的情況是十分常見，由於很多村屋都位於較偏遠、交通稀疏的地區，而村屋樓齡相對舊、又沒有屋苑管理的村屋，銀行估價更偏向保守。建議準買家應準備較多的流動資金，特別是有意承造做高成數按揭人士，一旦出現估價不足時，也可以應付其突發開支。

一般長達1 – 1.5個月時間，因銀行需要委託估價行進行估價，所以要更早預備按揭事宜及進行按揭比較。